Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms