Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

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Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
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