Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms