Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUOX2Q9NRD8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms