Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
BIN3Q9NQY0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
BIN3Q9NQY0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
BIN3Q9NQY0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
BIN3Q9NQY0 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
BIN3Q9NQY0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
BIN3Q9NQY0 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
BIN3Q9NQY0 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BIN3Q9NQY0 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms