Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms