Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ89

C12orf4, Protein C12orf4, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf4Q9NQ89 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf4Q9NQ89 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms