Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms