Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms