Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms