Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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