Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms