Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GORASP1Q9BQQ3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms