Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms