Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF11Q99590 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms