Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TCF12Q99081 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TCF12Q99081 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TCF12Q99081 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms