Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms