Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 MGST1-204ENST00000396209 979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 DUXAP7-201ENST00000431038 689 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 PPP1R26-AS1-201ENST00000455039 643 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 AC010931.3-201ENST00000561647 554 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 AC012181.2-201ENST00000570210 699 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms