Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms