Protein–RNA interactions for Protein: Q96PF2

TSSK2, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK2Q96PF2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSSK2Q96PF2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms