Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms