Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms