Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms