Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms