Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms