Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms