Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms