Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms