Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRN2Q92932 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms