Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms