Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms