Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms