Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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COPS9Q8WXC6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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