Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL22A1Q8NFW1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL22A1Q8NFW1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL22A1Q8NFW1 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL22A1Q8NFW1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL22A1Q8NFW1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
COL22A1Q8NFW1 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL22A1Q8NFW1 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
COL22A1Q8NFW1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL22A1Q8NFW1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL22A1Q8NFW1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL22A1Q8NFW1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL22A1Q8NFW1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL22A1Q8NFW1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL22A1Q8NFW1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL22A1Q8NFW1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL22A1Q8NFW1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL22A1Q8NFW1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL22A1Q8NFW1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL22A1Q8NFW1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL22A1Q8NFW1 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL22A1Q8NFW1 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL22A1Q8NFW1 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL22A1Q8NFW1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL22A1Q8NFW1 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL22A1Q8NFW1 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL22A1Q8NFW1 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL22A1Q8NFW1 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COL22A1Q8NFW1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL22A1Q8NFW1 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL22A1Q8NFW1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL22A1Q8NFW1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL22A1Q8NFW1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL22A1Q8NFW1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms