Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTC29Q8NA56 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms