Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms