Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms