Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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TRAPPC6BQ86SZ2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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