Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms