Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms