Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEND4Q6ZU67 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms