Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms