Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00575Q6W349 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms