Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms