Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPRIN2Q6IMN6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.2 ms