Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms