Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 LINC01922-201ENST00000562582 719 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TPRNQ4KMQ1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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