Protein–RNA interactions for Protein: Q499Z3

SLFNL1, Schlafen-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFNL1Q499Z3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms