Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms