Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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